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systems biology

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La biologie des systèmes explore comment les composants d'un organisme interagissent pour créer des comportements complexes, passant de l'étude isolée des gènes à une vision globale du vivant. Cette approche multidisciplinaire révèle les réseaux invisibles qui régulent la santé et la maladie, transformant notre compréhension fondamentale de la biologie.

Sur Gist.Science, nous parcourons quotidiennement bioRxiv pour repérer les tout nouveaux prépublications dans ce domaine. Pour chaque article, nous produisons à la fois une explication claire pour le grand public et un résumé technique détaillé, rendant ces recherches de pointe accessibles à tous sans sacrifier la rigueur scientifique.

Vous trouverez ci-dessous les dernières publications sélectionnées, prêtes à être découvertes et comprises.

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Heterogeneous, Population-Level Drug-Tolerant Persisters Exhibit Ion-Channel Remodeling and Ferroptosis Susceptibility

Cette étude remet en cause la vision des persistanceurs tolérants aux médicaments (DTP) comme des états cellulaires uniques pour les décrire comme des populations hétérogènes présentant un remodelage des canaux ioniques et une vulnérabilité accrue à la ferroptose, suggérant ainsi que leur éradication nécessite une approche de « paysagement ciblé » visant à réduire l'hétérogénéité phénotypique plutôt que de cibler un type cellulaire spécifique.

Hayford, C. E., Baleami, B., Stauffer, P. E., Paudel, B. B., Al'Khafaji, A., Brock, A., Quaranta, V., Tyson, D. R., Harr (…)2026-04-13
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Modeling and dissecting bidirectional feedback in gene-metabolite systems using the CausalFlux method

Le papier présente CausalFlux, une méthode innovante qui améliore la prédiction des flux réactionnels et des phénotypes de croissance chez *E. coli* en modélisant les boucles de rétroaction bidirectionnelles entre les gènes et les métabolites, surpassant ainsi les approches unidirectionnelles existantes.

Subramanian, N., Kumar, S. P., Rengaswamy, R., Bhatt, N. P., Narayanan, M.2026-04-13
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UQ-PhysiCell: An extensible Python framework for uncertainty quantification and model analysis in PhysiCell

Cet article présente UQ-PhysiCell, un cadre Python open-source extensible conçu pour faciliter l'analyse d'incertitude, l'étalonnage et la sélection de modèles au sein de l'écosystème PhysiCell en orchestrant des ensembles de simulations à grande échelle et en s'intégrant aux bibliothèques d'analyse statistiques existantes.

L. Rocha, H., Bucher, E., Zhang, S., Deshpande, A., Bergman, D. R., Heiland, R., Macklin, P. R.2026-04-08
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Kinome profiling allows examination and prediction of kinase inhibitor cardiotoxicity

Cette étude démontre que le profilage kinome par protéomique couplé à l'apprentissage automatique permet d'identifier les kinases hors cible associées à la cardiotoxicité des inhibiteurs de kinases et de prédire les risques cardiovasculaires avec une précision élevée, offrant ainsi un cadre mécaniste pour la conception de médicaments plus sûrs.

Tabet, J. S., Joisa, C. U., Jensen, B. C., Gomez, S. M.2026-04-07
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Integrative Multi-cohort Transcriptomics and Network Pharmacology Analysis Reveals Key Network Nodes and Potential Drug Clues in PCOS Granulosa Cells

Cette étude intègre la transcriptomique multi-cohortes et la pharmacologie des réseaux pour identifier CD44 comme nœud clé et proposer des candidats médicamenteux repositionnables, tels que le flufenamate et la cytosporone B, pour le traitement du syndrome des ovaires polykystiques.

Zhang, X., Fang, J., Liu, Z., Li, S., Jin, F., Guo, L., Qiang, R., Zhu, Y., Hou, T., Li, J., Liu, Y.2026-04-06
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Investigating the dynamics of heat acclimation in pig through transcriptome analysis of blood samples

Cette étude utilise l'analyse du transcriptome sanguin pour révéler que l'acclimatation à la chaleur chez le porc implique une réponse biphasique coordonnée, caractérisée par une activation immunitaire précoce lors de l'acclimatation à court terme suivie de réajustements métaboliques complexes, notamment dans la production d'énergie mitochondriale, durant l'acclimatation à long terme.

Huau, G., Liaubet, L., Labrune, Y., Campos, P. H. R. F., Gilbert, H., Renaudeau, D.2026-04-06
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Speed-Dependent Turning Strategies in Quadrupedal Locomotion: Insights from Computational Modeling

En s'appuyant sur un modèle computationnel de la locomotion quadrupède, cette étude démontre que les animaux adaptent leur stratégie de virage (flexion du corps, application de force latérale ou déplacement latéral des membres) en fonction de leur vitesse, les membres antérieurs jouant un rôle prépondérant dans la direction tandis que les postérieurs assurent la propulsion et la stabilité.

Molkov, Y. I., Mohammed, M. A. Y., Stell, T., Harralson, A., Jeter, R., Rybak, I. A.2026-04-02